Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Brf1Q8CFK2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brf1Q8CFK2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms