Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Fbxo48Q8CAT8 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fbxo48Q8CAT8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fbxo48Q8CAT8 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fbxo48Q8CAT8 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Fbxo48Q8CAT8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Fbxo48Q8CAT8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms