Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp44Q8C2S0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Usp44Q8C2S0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp44Q8C2S0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms