Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc30Q8BVF4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc30Q8BVF4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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