Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp54Q8BL06 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms