Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Q8BGC1 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q8BGC1 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms