Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SnupnQ80W37 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms