Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Ube2q1Q7TSS2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.5 ms