Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Smim12Q78RX3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms