Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Snrnp200Q6P4T2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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