Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Arhgap20Q6IFT4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Arhgap20Q6IFT4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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