Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atg9bQ6EBV9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg9bQ6EBV9 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms