Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nop58Q6DFW4 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms