Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PatjQ63ZW7 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms