Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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JrkQ60976 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
JrkQ60976 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms