Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnot7Q60809 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms