Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm12248-203ENSMUST00000219877 1160 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atf3Q60765 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atf3Q60765 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Glrx2-206ENSMUST00000145969 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atf3Q60765 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atf3Q60765 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms