Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Xrcc1Q60596 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Xrcc1Q60596 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms