Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Acsf3Q3URE1 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Acsf3Q3URE1 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms