Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Sec31aQ3UPL0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms