Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Prmt1-214ENSMUST00000209124 741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sf3b2Q3UJB0 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sf3b2Q3UJB0 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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