Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Puf60Q3UEB3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Puf60Q3UEB3 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms