Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rnf149Q3U2C5 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms