Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctdnep1Q3TP92 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctdnep1Q3TP92 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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