Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Samd11Q1RNF8 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms