Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Traf3ip1Q149C2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Traf3ip1Q149C2 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Traf3ip1Q149C2 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Traf3ip1Q149C2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Traf3ip1Q149C2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms