Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Itgb8Q0VBD0 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
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Itgb8Q0VBD0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Itgb8Q0VBD0 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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