Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gpr151-201ENSMUST00000054738 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gpx6-201ENSMUST00000004453 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Igsf5-204ENSMUST00000113795 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm11295-201ENSMUST00000121379 803 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC139155.1-201ENSMUST00000226043 444 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm15353-201ENSMUST00000110860 702 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm14108-201ENSMUST00000122234 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm44460-201ENSMUST00000196179 129 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ubxn2bQ0KL01 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms