Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rbp4Q00724 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms