Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Shc1P98083 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shc1P98083 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms