Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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