Protein–RNA interactions for Protein: P82349

Sgcb, Beta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcbP82349 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
SgcbP82349 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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