Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SgcdP82347 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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