Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smad1P70340 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smad1P70340 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms