Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pou3f4P62515 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms