Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg6P61406 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms