Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 C130036L24Rik-202ENSMUST00000137643 3109 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Cd1d1-201ENSMUST00000029717 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csrnp3P59055 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csrnp3P59055 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms