Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp25P57080 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Usp25P57080 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms