Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
NcanP55066 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
NcanP55066 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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NcanP55066 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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NcanP55066 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
NcanP55066 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NcanP55066 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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