Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LtbrP50284 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LtbrP50284 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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