Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cdkn1bP46414 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms