Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms