Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpl28P41105 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpl28P41105 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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