Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ThpoP40226 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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