Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Gm10413-202ENSMUST00000177913 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Hoxa10P31310 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxa10P31310 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms