Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms