Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pabpc1P29341 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms