Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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RxrgP28705 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RxrgP28705 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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