Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde6aP27664 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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