Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Clk1P22518 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Clk1P22518 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Clk1P22518 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clk1P22518 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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